Su establecimiento en el año 1590 en el Bajío, una región conocida por su riqueza en yacimientos minerales, estuvo motivado por la entrega de propiedades como la mina en el Real de Comanja, las haciendas de Loza de Arriba y Loza de Abajo, La Joya y San Isidro, que les permitieran sostener la orden jesuita. 

Como parte de su estrategia económica, se basaron en un sistema de administración de tierras y recursos naturales, en el cual las misiones eran consideradas unidades económicas autosuficientes. 

A  través de la adquisición de tierras, haciendas y granjas en las cuales se practicaba la agricultura y la ganadería, los jesuitas desarrollaron la minería y  obtuvieron derechos de explotación convirtiéndose en importantes actores en la industria minera de la época.

Durante el periodo colonial en Nueva España, la minería fue un fenómeno de gran relevancia histórica y económica. En el siglo XVIII se dieron impresionantes bonanzas mineras iniciando en Taxco, Pachuca-Real del Monte, y sobre todo Guanajuato;